Школа открылась в 1994 году и стала центром образования и базовой для НИУ ВШЭ, а в 2014 году присоединила школу здоровья № 1941. С 2017 года предпрофильное обучение началось уже в 7-8 классах. Годом ранее были открыты технологические, физико-математические, инженерные, гуманитарные, естественнонаучные, социально-гуманитарные и социально-экономические классы. Тогда же школе присвоен официальный статус центра подготовки к Кембриджским экзаменам. Учебное заведение участвует в проекте «Инженерный класс в московской школе».